Ursprünglich haben sich die stationären Wohnangebote für Menschen mit geistiger Behinderung hauptsächlich auf den Standort Ecksberg, später dann auch in Bachham bei Heldenstein und in Berg bei Schnaitsee konzentriert. Heute finden sich Wohnangebote für Menschen mit geistiger Behinderung in Ecksberg und in Ramsau in Wohnheimen mit 40 bis 90 Bewohnern. Daneben bietet die Stiftung Ecksberg auch Wohnplätze in neun Außenwohngruppen in den Gemeinden bzw. Städten Ampfing, Gars, Mettenheim, Mühldorf, Oberbergkirchen, Neumarkt St. Veit und Waldkraiburg. Zu diesen Außenwohngruppen gehören teilweise auch angegliederte Ein- und Zweizimmerwohnungen.

Die stationären Wohnangebote für Menschen mit geistiger Behinderung werden von zwei Bereichen verantwortet, dem Bereich "Wohnen Ecksberg und Wohngemeinschaften" sowie dem Bereich "Wohngemeinschaften Ramsau", dem auch die Förderstätte in Ramsau organisatorisch angegliedert ist.